长江上游珍稀鱼类保护区为国家湿地自然保护区。位于长江上游地区，由长江上游珍稀鱼类国家自然保护区管理处管理。1997年由原泸州市长江珍稀特有鱼类自然保护区和宜宾地区珍稀鱼类自然保护区合并成立长江合江-雷波段省级自然保护区，2000年晋升为国家保护区，2005年改为今名。保护对象为白鲟、达氏鲟、胭脂鱼等珍稀、特有鱼类及其产卵场。保护区内淡水鱼类资源丰富，具有区系组成独特、珍稀濒危物种多、特有种多等特点。区内有金沙江水电一期工程建设后存留的白鲟惟一产卵场。